目前临床上检查口臭的方法主要有两种：感官检测法和仪器检测法。感官法是从患者口中收集样本，由专业人员直接嗅辨的方法来判断是否有口臭。感官法与自我检查法类似，只是专业人员是训练有素和经验丰富的医生。感官检测当时就可知道结果，过程简单，并且经验丰富的专业检查人员能够检查出多种原因产生的口臭。常用的检查口臭的仪器主要有气象色谱仪和硫化物检测仪，主要是检测口腔中可挥发性硫化物的浓度，这是导致大多数口臭的主要化学成分，包括硫化氢、甲硫醇和二甲基硫，通过检测浓度值的高低进行诊断。
由于口臭多数是由口腔原因引起的，所以检查口臭首先要到口腔医疗机构，先进行详细的检查，明确病因。如果排除了口腔原因，口腔医生会医院继续接受治疗。医院已经开设了专门的口臭门诊。
明确诊断是治疗的基础。首先，医生会对患者进行一系列的检查，诊断口臭产生的原因，这些检查包括口臭浓度和成分的检查、口腔健康检查、舌苔的检查、口腔卫生习惯的调查、饮食习惯调查、生活习惯调查、病史调查、用药情况调查等。然后，根据诊断结果对患者的口臭进行分类。针对生理性口臭患者，以进行专业性的口腔卫生指导为主，帮助患者形成正确和良好的口腔卫生习惯；针对由于口腔疾病或全身疾病引起的口臭患者，在进行口腔卫生指导的基础上再进行有针对性的治疗，切断口臭产生的根源；而针对假性口臭和口臭恐惧症患者，除进行口腔卫生指导外，还会辅以心理辅导。另外，医生还会根据患者的不同情况，指导患者使用含有对口臭有抑制作用的漱口液，这些对口源性口臭都有较好效果。
患者在检查前不要吃刺激性食物，如大蒜、洋葱、韭菜等，也不要用芳香味的化妆品，检查前两小时内尽量不要抽烟、喝酒、吃东西，这些都会干扰检查结果，影响诊断的准确性。
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